Fraunhofer-Institut für Algorithmen und Wissenschaftliches Rechnen SCAIOntologien und Terminologien dienen als Grundlage für die semantische Interoperabilität in Knowledge-Discovery-Systemen. Als Forschungsgruppe, die auf eine lange Geschichte im Aufbau von Ontologien und Terminologien zurückblicken kann, stellen wir hier eine erste Version der COVID-19-Ontologie vor, die alle verschiedenen Aspekte rund um diese Viruserkrankung umfasst. Die aktuelle Version der COVID-19-Ontologie wurde mit Protégé 5.2.0 erstellt. Die Konzepte in der Terminologie stammen hauptsächlich aus Publikationen und COVID-19-bezogenen Websites. In ihrer aktuellen Version enthält die Ontologie 2260 Klassen von Konzepten und 39395 Axiome (2484 logische Axiome und 2416 Deklarationsaxiome). Wir haben diese Information über BioPortal mit der wissenschaftlichen Gemeinschaft geteilt. Die Hauptklassen konzentrieren sich auf Wirkstoffe, Epidemiologie, Virusbiologie, Virus-Wirt-Interaktionen und medizinische Aspekte wie Diagnostik.
Auf der Grundlage dieser COVID-19-Ontologie haben wir eine Terminologie ausgearbeitet, die hauptsächlich im Bereich des Text Mining in Form von Wörterbüchern zum Indexieren und Abrufen von COVID-spezifischer Literaturverwendet wird. Wir verwenden die Terminologie auch, um COVID-19-spezifische Entitäten in Wissensgraphen zu referenzieren und zu standardisieren.
Die Terminologie kann als .owl-Datei heruntergeladen werden. Wir haben die Terminologie auch in unsere Instanz des Ontology Lookup Service (OLS) aufgenommen, auf den hier zugegriffen werden kann.
Wir sind noch dabei, zusätzliche Einträge hinzuzufügen und die Annotationseigenschaften der Konzepte fertigzustellen. Nach der Fertigstellung der Terminologie planen wir ein Upgrade der Terminologie zu einer vollständigen Ontologie: der COVID-19-Referenzontologie. Wir laden andere Gruppen weltweit ein, sich zusammenzuschließen, um diese Referenzontologie in einer gemeinsamen Anstrengung zu erstellen.
Wie alle unsere COVID-19-Ressourcen wird auch die COVID-19-Terminologie ohne Einschränkungen mit der gesamten wissenschaftlichen Gemeinschaft geteilt.